Слово АГРОНОМ произошло от греческого agrOs - поле и nomos - закон. Так называют специалиста в области земледелия и сельского хозяйства.
Это слово словарное, проверить гласную О в корне слова с помощью однокоренных слов нельзя. Правописание дает орфографический словарь, его нужно запомнить.