Западный Саян - температура здесь опускается на 1° на каждые 150 м подъёма. Разница в длине тёплого периода года между осевыми хребтами и предгорьями около 40 дней.
Восточный Саян - средние температуры января колеблются от −17 до −25 °C, средние температуры июля — от 12 до 14 °C.