Животные вдыхают кислород, выдыхают углекислоту. растения - наоборот. и не только: растения очищают воздух, организмы могут выделять разные вещества, влиять на уровень влажности.
гидросфера: кто-то её замусоривает, кто-то очищает. Всякие там устрицы очищают, всякие камыши - замусоривают.
Земная кора: ну, организмы, умирая и превращаясь в минеральные отложения, составляют её часть.