Коренной - это тот, кто родился в каком-либо городе и живет в нем. (Это значение сейчас большинство людей употребляют)
Из толкового словаря:
1) исконный, постоянный, основной. Например: Коренные жители города. Коренной москвич. 2. Затрагивающий основы чего-нибудь, существенный, радикальный. Например: Коренные преобразования. Коренным образом. 3. Главный, самый большой. Например: Коренной якорь, коренная пара.