Под водой.
Мы знаем ( или должны знать )
У существительных 1-го склонения в начальной форме окончание и в М. Р и в Ж. Р -а или -я. У существительных 2-го склонения в начальной форме окончание в М. Р нулевое, а в СР. Р -о или -е. У существительных 3-го склонения в начальной форме в Ж. Р нулевое окончание, а слово оканчивается на МЯГКИЙ ЗНАК.
Вывод: водой - начальная форма ВОДА. У слова Вода окончание -А, значит это 1 склонение!)
Надеюсь я правильно поняла твой вопрос!)
Желаю успехов в учебе!)