Начинается это заболевание с кишечника. Кандидоз кишечника может возникать при значительном снижении объема нормальной микрофлоры кишечника, которая участвует в пищеварении и подавляет рост условно-патогенной микрофлоры, способной в любой момент вызвать заболевание кишечника. В состав условно-патогенной микрофлоры большинства людей входят дрожжеподобные грибки рода Candida – возбудители кандидоза.При применении антибиотиков, особенно широкого спектра действия, уничтожается не только патогенная и условно-патогенная бактериальная микрофлора, но и нормальная микрофлора. А так как антибиотики не подавляют жизнедеятельность грибков рода Candida, их популяция начинает бурно расти и вызывает кандидоз. Иногда кандидоз кишечника связан не с антибиотиками, а со сниженным иммунитетом.Для того чтобы грибковая инфекция распространилась на другие органы желудочно-кишечного тракта, требуется снижение иммунитета. Поэтому кандидоз всего желудочно-кишечного тракта чаще всего встречается у больных с нарушениями иммунитета. Кандидоз желудочно-кишечного тракта включает в себя кандидоз полости рта, глотки, пищевода, желудка и кишечника.