Шероховатая ЭПС содержит рибосомы, где происходит биосинтез белка. Синтезированные белки проходят через мембрану в ЭПС, накапливаются, дозревают, перемещаются.
Также шероховатая ЭПС связана с ядерной оболочкой.
Таки образом, основные функции: синтез белка, изоляция синтезированных белков.