Морфологическое сходство организмов базируется на единстве ембриональных закладок различных органов и систем, с которых в следствие и развивается одинаковые части организмов.
Различие основано на том же принципе, поскольку на ранних этапах онтогенеза развитие эмбриона повторяет вкратце филогенез и как следствие с тех же эмбриональных закладок развиваются различные органы и системы, что в конечном результате даёт морфологическое различие.