Относится ли слово "зарница" к словам с чередующей гласной в корне. Если да то объясните...

Да, данное слово относиться к корням зар - зор.
Правописание этих корней зависит от ударения - под ударением пишется гласная в соответствии с произношением, без ударения - а: зарево, зорька - зарница, озарять. Исключение: зоревать.