В основном формой обрядов. У католиков в церкви сидят, у православных - стоят.
У православных таинство евхаристии совершается за иконостасом, скрыто, у католиков все на виду. Православные служат на церковнославянском языке, католики - на языке страны, где идет служба (раньше, до 2 Ватиканского собора - на латыни)
Еще наличием центрального руководящего органа во главе с римским папой. Православные церкви разрознены и некоторые даже не имеют между собой литургического общения.
Священники могут переходить из православия в католичество и наоборот - священство сохраняется. Католик может причащаться в православном храме (если в городе нет костела) .
Католики живут по новому стилю, православные - по старому (только РПЦ и некоторые греческие монастыри)
Так что различия минимальные.