Самовар образовано от двух слов это: САМ и ВАР.
О - это соединительная буква которая соединяет два слова. САМОВАР, то есть САМ ВАРИТ.
Если разбирать по морфемам то первый корень -сам , потом идет соединительная гласная -о , затем корень -вар и нулевое окончание