Под влиянием произношения изменилось слово "калач": ранее его писали как "колач" от от общеславянского kolač / kolo — "круг". В процессе развития языка часто случаются определенные изменения как в написании, так и в произношении слов, и слово "калач" - не исключение. Действительно, мы произносим его как [к а л а ч'], и поэтому написание изменилось в сторону, более приятную и глазу, и уху - в сторону произношения.