1 had written ( написали на 200 лет раньше, чем учитель объяснил) is working (работает и сейчас)
2 worked were living (работали одновременно с тем как жили) Но мне кажется, можно и lived
3 came had finished (закончил читать раньше чем брат пришёл)
4had signed (подписал до наступления 6 часов)
5 had begun (раньше чем Джеймс прибыл) arrived