различие в том,что атом никак не заряжен тоесть его заряд "0"
а ион может быть заряжен "+" или "-" ,но ион фтора ПОЧТИ всегда зарен отрицательно.
Различие есть ещё в том,что атом может принять несколько электронов или отдать несколько электронов и стать ионом.
Сходство состоит в том,что количество нейтронов и протонов одинаковое,а количество электронов разное!