Эстуа́рий (от лат. aestuarium — затопляемое устье реки) — однорукавное, воронкообразное устье реки, расширяющееся в сторону моря.
Образование эстуария происходит, если приносимые рекой наносы удаляются морскими течениями или приливом, и прилегающая к устью часть моря имеет значительные глубины; в этих случаях отложение наносов не происходит даже при большом их выносе на устьевом участке.
Устья в виде эстуария имеют такие реки, как Енисей, Темза.
Противоположностью эстуария является дельта — устье, разделенное на несколько протоков. Классическими дельтами обладают такие реки, как Нил, Волга, Амазонка