Реки Подмосковья принадлежат двум бассейнам: Волжскому иОкскому. Водораздел между ними проходит по Смоленско-Московской возвышенности и Клинско-Дмитровской гряде.
Волга протекает на самом севере Подмосковья, на границе с Тверской областью. Там, у города Дубна берет свое начало канал имени Москвы, связывающий Москва-реку с Волгой. Крупнейшие притоки Волги в границах Московской области – реки Дубна и Сестра. Они берут свое начало на северных склонах Клинско-Дмитровской гряды, в верховьях протекают в глубоких долинах, часто лишенных террас. Местами в них встречаются пороги и перекаты. При выходе на Верхне-Волжскую низменность течение становится более спокойным.
На юге области протекает Ока – приток Волги (которая впадает в последнюю у Нижнего Новгорода). Здесь проходит граница между Московской, Калужской и Тульской областями. Ока привольно протекает по широкой террасированной долине, ее берега подчас круты, встречаются оползни. Ока является также естественной границей двух природных зон. К северу от нее произрастают смешанные леса, к югу в оврагах и балках Среднерусской возвышенности сохранились остатки некогда многочисленных широколиственных лесов.
Другой важнейшей рекой Подмосковья является Москва-река. Она берет свое начало близ деревни Старково в Можайском районе, у города Коломна впадает в Оку. Долгое время Москва-река отличалась непостоянным стоком, то почти пересыхая, а то сметая все на своем пути. Сейчас уровень воды в Москва-реке регулируется: выпрямлено русло, построена система водохранилищ и шлюзов, через канал имени Москвы обеспечивается поступление волжской воды.

Москва-река и Московский Кремль
На западе и юге области протекают основные притоки Москва-реки:Руза, Озерна, Истра, Пахра, Колочь. Пологие и мягкие берега сменяются крутыми и обрывистыми, среди невысоких холмов реки образуют широкие излучины.
Крупнейшими притоками Оки являются Нара, Клязьма, Лопасня.
По Мещерской низменности, среди низких болотистых равнин протекают реки Цна, Нерская, Ялма. Их берега часто илистые и топкие, вода имеет красноватый оттенок из-за примесей железа.
Еще одной рекой Подмосковья, но уже рукотворной, является канал имени Москвы, длина которого достигает 128 км. Он был создан силами заключенных Дмитлага в 1932-1937 годах. Благодаря каналу в Москва-реку стала поступать волжская вода, удалось решить проблему водоснабжения столицы. Москва стала портом пяти морей, получив выходы к Балтийскому, Белому, Каспийскому, Азовскому и Черному морям. На месте низменностей, болот, рек и речушек образовались живописные водохранилища: Икшинское, Пестовское, Пяловское, Клязьминское, Химкинское. В настоящее время они стали популярными зонами отдыха москвичей и жителей Подмосковья. Здесь построены пансионаты, дома отдыха, яхт-клубы, спортивно-оздоровительные центры и др. К сожалению, берега активно застраиваются элитными коттеджными поселками, почти перекрывая выход к воде.

На Икшинском водохранилище
Среди многочисленных озер Подмосковья самое большое –Сенежское, которое находится близ города Солнечногорск. Оно искусственного происхождения. Его площадь составляет 15,4 кв.км.
На Мещерской низменностисформировались целые «созвездия» озер. Крупнейшие находятся у Шатуры (оз. Святое) и около поселка Черусти (озера Великое и Долгое).