У нас тоже сначала ходил на пелёнку, а сейчас на пол :(( Может, у вас собачка метит территорию? Мы закрываем нашего на пару минут в туалете, чтобы он "сделал свои дела". Моем после него хлоркой или уксусом, иногда наругаем. Вроде бы сейчас такого не происходит.
Или еще может быть, что собачка боится заходить в туалет. У нас как-то бутылка упала на песика и он боялся туда идти и тоже ходил на пол.