Здание химической лаборатории было расположено в глубине участка Бонова двора.
"Бонов Дом" - дом, в котором Ломоносов жил с июня 1741 по сентябрь 1757 г.
Этот дом и примыкающий к нему участок между Средним и Малым проспектами по 2-й линии Васильевского острова до конца XVIII в. были известны по имени первого владельца — генерала Г. И. Бона, у которого их приобрел К. Бреверн. В 1732 г. дом и участок у него арендовала Академия наук, чтобы поселить в нем своих служащих. На участке в 1736 г. был разбит Ботанический сад («академический огород») . В 1739 г. Бреверн отказался продлить аренду, и Академия была вынуждена купить Бонов дом.
8 июня 1741 г. М. В. Ломоноcов вернулся из-за границы. По возвращении он получил две (затем три) комнаты в недавно приобретенном Академией наук "Боновом доме".
Вход в дом был со 2-й линии. Дом был деревянный на каменном фундаменте, с теплыми погребами.
В документе 1743 г. квартира Ломоносова описана так: "в трех покоях печи изразчатые, двери и полы ветхие". Впоследствии дом был снесн, на его месте выстроены каvенные здания (N 56 и 58 по 1-й линии, дом N 53 по 2-й линии) .
В июле 1747 г. Ломоносов получил в том же доме квартиру в пять комнат. В Боновом доме Ломоносов прожил до сентября 1757 г.
В 1748 г. во дворе академичского дома была построена первая русская химическая лаборатория. Семилетняя борьба Ломоносова за создание первой в России научной химической лаборатории, начатая им в 1741 г. , окончилась его победой.
Судьба лаборатории после смерти Ломоносова.
22 марта 1757 года Канцелярия Академии наук предписала студенту академии (ученику М. В. Ломоносова) Василию Ивановичу Клементьеву (1731-1759) передать все оставшиеся вещи и материалы в ведомство преемника Ломоносова по кафедре химии, профессора Сальхова У. Х. (1722-1787).
Ульих-Христофор Сальхов практически ничего не сделавший для лаборатории уехал в 1760 году за границу. Мало, что сделал и его преемник академик Иоганн-Готтлиб Леман (1700-1767).
В 1770 году исполняющим должность профессора химии был назначен Кирилл Густавович Лаксман. В течение ряда он вел экспериментальные работы в лаборатории. Однако его труды пропали после наводнения 1777 года.
Лаборатория возродилась в 1780-х годах, когда ее принял в свое ведение адъюнкт, а затем академик Никита Петрович Соколов (1748-1795).
В 1975 году Соколов начал в ней курс лекций по химии, иллюстрируя их многочисленными опытами, возродив Ломоносовскую традицию.
В 1792 году по прошению Соколова директор АН Дашкова Екатерина Романовна (1744-1810) освободила его от заведывания лабораторией. Руководство ею было возложено на адъюнкта Захарова Якова Дмитриевича (1765-1836).
В 1793 году участок на 2-й линии, принадлежащий Академии наук, по указу Екатерины II, был продан в частные руки. Участок, выходивший на 2-ю линию, включавший бывшую химическую лабораторию и жилой дом, в котором некогда жил Ломоносов, в начале 19 века принадлежал академику Озерецковскому Николаю Яковлевичу, который перестроил здание лаборатории под жилье.
В дальнейшем здание лаборатории и деревянный дом, где жил Ломоносов, находились во владении разных лиц.