Озера по территории Африки распространены крайне неравномерно. Котловины озер имеют самое разное происхождение. Тектонические озера расположены в грабенах по линии Великих Восточно-Африканских разломов. Озера вытянутые, узкие, очень глубокие. Так, озеро Танганьика с севера на юг протянулось на 650 км и имеет максимальную глубину в 1435 м (второе по глубине озеро в мире после Байкала). Озеро Виктория - самое большое в Африке по площади (68 тыс. км 2 ), второе пресное озеро в мире после озера Верхнего в Северной Америке. Котловина озера Виктория находится не в разломе, а в пологом прогибе платформы, поэтому оно имеет небольшие глубины (средняя глубина около 40 м, максимальная - 80 м) и низменные изрезанные берега.
Озеро Чад бессточное, мелководное (средние глубины 4-7 м). Площадь его в зависимости от количества осадков и режима впадающих в озеро рек увеличивается в дождливый период почти вдвое. На Эфиопском нагорье есть озера вулканического происхождения . Так, оз. Тана, из которого вытекает Голубой Нил, образовалось путем подпруживания долины реки лавовыми потоками во время извержения вулканов.