Берёт начало на склонах Чатыр-Дага от слияния рек Ангары и Кызыл-Коба на высоте 390 м над уровнем моря, впадает в залив Сиваш. Около города Симферополь образуетводохранилище. Пересекается Северо-Крымским каналом.Долина преимущественно ящикообразная, в нижнем течении нечётко выражена, в приустьевой части отсутствует. Ширина долины колеблется в пределах от 300—600 м (в верховьях) до 2—3 км (в низовьях). Русло извилистое, ширина его колеблется в пределах от 3—3,5 км до 8—15 км; в нижнем течении спрямлено и обваловано. Глубина на перекатах достигает 0,3—0,5 м, на плёсах — до 1,6 м. Падение русла в предгорной части достигает 6 м/км, в степной — 0,27 м/км.В начале четвертичного периода древний Салгир был более многоводным, воды его текли быстрее и в ином направлении ниже Симферополя[4]. Четыре древних Салгира оставили после себя обширные полосы галечников и песка. Один из них впадал в Каркинитский залив по Чатырлыкской балке[5], остальные три впадали в Чёрное море близ современной Евпатории. После того как Тарханкутский полуостров начал своё постепенное поднятие, воды Салгира потекли в сторонуСиваша. До 50-х годов XX в. Салгир считался притоком более полноводной реки Биюк-Карасу, так как Салгир не всегда доносил свои воды до места слияния с ней[3].В летнее время в верховьях (выше Симферополя) река изредка пересыхает, ниже по течению ежегодно более чем на 3 месяца. Максимальное половодьенаблюдается весной в связи с таянием снега в горах, вторичное также и в осенне-зимний период когда часты дожди и мокрый снег. В декабре 1933 г. на Салгире был зафиксирован рекордно высокий расход воды — 118 м³/с (при среднегодовом расходе всего 1,29 м³/с у села Пионерское). Замерзает река не каждую зиму.