язычество просто устарело, явления обьясняемые проявлением божественной воли стали обьясняться, и бог который метал молнии стало быть не существует, так постепенно религия которая предполагает веру в недоказуемое, а соответственно научно не опровергаемая, просто вытеснила неактуальные верования.