Усложнение протобионтов привело к появлению бактерий. С этого момента начинает осуществляться биологическая эволюция организмов.
По мере возрастания числа гетеротрофные бактерии происходило уменьшение пищевых ресурсов. Между этими организмами возрастала конкуренция. Это способствует появлению автотрофов (синтезируют органические вещества из неорганических, используя энергию солнечного света, или энергию, полученную в результате окисления минеральных веществ.