Водные ресурсы Западной Сибири очень велики. Их основу составляет сток одного из крупнейших в стране Обь-Иртышского речного бассейна, к которому добавляется сток рек Пур и Таз, впадающих в Обскую губу Карского моря.
Водообеспеченностъ в целом высокая в 1,5 раза превышающая средний показатель по России. Однако в некоторых регионах периодически возникает дефицит водных ресурсов: в засушливой степной части Алтайского края и Новосибирской обл., а также в регионах, испытывающих качественное (связанное с загрязнением) истощение вод (Кемеровская и Томская обл.). В Томской обл. даже было построено специальное Крапивинское водохранилище на р. Томи с целью разбавления загрязненных вод.