Самый главный - что поверхность Земли сферическая (ну, более-менее) , а карты - плоские. Значит, неизбежны искажения, особенно для мелкомаштабных карт, где на одном листе помещается обширная территория, с континент размером.
Второй недостаток - масштабные ограничения. Понятно, что мелкие объекты на карту не нанести - как в силу полиграфических ограничений (ну просто не пропечатать совсем мелкие линии...) , так и потому, что они уже будут неразличимы глазом или же сделают саму карту нечитаемой. Так что поневоле приходится ограничивать объём информации, который представлен на карте.