Скелет крокодила похож на строение скелета динозавра: две височные дуги и диапсидный череп. Для дополнительной защиты в брюшной части есть ребра, которые не соединены с позвоночником.
Чтобы дыхание крокодила не мешало ему быстро передвигаться, существуют специальные мышцы в области диафрагмы. Сердце крокодила 4-х камерное,особый механизм смешивания крови из артерий и вен, даёт возможность регулировать процесс кровоснабжения.Мочевого пузыря нет. Большие полушария мозга покрыты корой, очень развит слух и зрение.