За годы боярского правления в государстве ослабла центральная власть, усилились бесконтрольность кормленщиков. Летом 1547 года на почве недовольства народом правящими группировками, произошло Московское восстание, в результате были разворованы усадьбы Глинских. Но у боярского правления были и положительные последствия, например, губная реформа. По ней от наместников к специально выбранным представителям местных дворян передавали данные о разбоях и воровстве. Это было сильным шагом к реорганизации управления на сословно-представительных началах.
В общих чертах итоги боярского правления носили все же негативный характер. Оно привело к усилению социальных противоречий и ослаблению международных позиций Русского государства. Казанское ханство заняло враждебную позицию по отношению к Русскому государству, отношения со странами Европы застыли на месте.