Покрытосеменные обладают цветками, а голосеменные - нет.
Покрытосеменные растения проходят двойное оплодотворение (этот процесс открыл Навашин), при втором оплодотворении получается триплоидный эндосперм с запасом питательных веществ, который питает зародыш семени при прорастании.