я не очень хорошо поняла вашего вопроса, но отвечу так:
если мы хотим проверить, какой гласный пишется в слове мы подбираем к нему проверочное слово. К примеру:
слово р...ка. Не знаем, что писать рЕка или рИка. Проверяем: проверочное слово рЕки(мн.ч.). То есть если в слове, которым мы проверяем эта буква стоит под ударением, она и пишется. Но есть словарные слова, к которым нельзя подобрать проверочные. Это слова исключения, их надо запомнить.
кстати, в некоторых словах можно букву Е проверить буквой Ё под ударением. Например:
слово ежи: ижи или ежи? слово ежи можно проверить словом ёж. Значит в слове ежи будет стоять буква Е. Но есть и другое правило на окончания, там тоже проверяется гласная ударением, но надеюсь, что ты имела ввиду именно то правило.