Из млекопитающих к этой категории относятся:
прибайкальский черношапочный сурок и снежный барс (ирбис).
Из птиц к краснокнижным видам относятся ряд очень редких видов, которые встречаются в области во время пролёта и залётом: кудрявый пеликан, горный гусь, степной лунь, орлан – долгохвост, стерх, восточная дрофа, белая чайка и некоторые другие. А вот лебедь-клоктун, ранее обычный и даже многочисленный вид, в настоящее время стал очень редким.
Многие виды краснокнижных хищных птиц: скопа, степной орёл, орлан – белохвост, кречет, балабан и сапсан – снижают свою численность. Численность балабана очень низка (нелегальный отлов на продажу).
Редкими видами птиц являются камышовая овсянка, серая цапля, бородатая куропатка, перепел, белая лазоревка, голубая сорока, огарь, клинтух, серый журавль, малый перепелятник, чёрная крачка, таёжный гуменник и др.
Низкая численность характерна и для земноводных (монгольская и серая жаба). Из пресмыкающихся (прыткая ящерица, обыкновенный уж, узорчатый полоз).