Самый большой казус вышел с членистоногими и кольчатыми червями. Эти два типа животных анатомически очень похожи друг на друга. Для них характерно членистое (сегментированное) тело с парой конечностей на каждом сегменте, причем строение конечностей во многом сходно (см. рисунок). В обоих случаях конечность исходно двуветвистая (состоит из спинной и брюшной ветви, или экзоподита и эндоподита), а сверху на ней часто имеются дыхательные (жаберные) придатки. Неудивительно, что специалисты по сравнительной анатомии уверенно выводили членистоногих из кольчецов, а конечности их считали гомологичными (имеющими общее происхождение): экзоподит конечности членистоногих выводился из спинной ветви параподии кольчецов и т. д.