Слово 3) протопить не является родственным другим словам, хотя на вид корень у них кажется одинаковым: -топ-. Просто другой смысл:
протопить - прогреть топкой, заниматься топкой.
Остальные слова имеют значение глагола топать: стучать, бить ногой об пол или землю.