Классификация
В классификации пресмыкающихся много неясного, во многом потому, что большая их часть вымерла.
Класс или группа: Пресмыкающиеся (Reptilia)
Подкласс Анапсиды (Anapsida)
Отряд † Captorhinida
Отряд Черепахи (Testudines или Chelonia)
Отряд † Котилозавры (Cotylosauria)
Отряд † Procolophonomorpha
Подотряд † Мезозавры (Mesosauria) = (Proganosauria)
Подкласс Диапсиды (Diapsida)
Отряд † Araeoscelidia
Группа † Avicephala
Группа Эозухии (Eosuchia)
Группа † Acerosodontosauridae
Группа Neodiapsida
Отряд † Araeosceloidea
Отряд † Ихтиозавры (Ichthyosauria)
Отряд † Younginiformes
Надсемейство † Younginoidea
Инфракласс Lepidosauromorpha
Надотряд † Зауроптеригии (Sauropterygia)
Отряд † Placodontia
Отряд † Nothosauroidea
Отряд † Плезиозавры (Plesiosauria)
Надотряд Лепидозавры или чешуйчатые ящеры (Lepidosauria)
Отряд Клювоголовые или хоботноголовые (Rhynchocephalia)
Отряд Чешуйчатые (Squamata): ящерицы и змеи
Инфракласс Архозавроморфы
Отряд † Rhynchosauria
Отряд † Prolacertiformes
Отряд † Проторозавры (Protorosauria)
† Текодонты (Thecodontia) — устаревший класс, в настоящее время рассматривается как парафилетический
Группа Архозавры (Archosauria)
Группа Круротарзы (Crurotarsi)
Надотряд Crocodylomorpha
Отряд Крокодилы (Crocodylia или Crocodilia) — единственные выжившие современные представители
Отряд † Sphenosuchia
Отряд † Rauisuchia
Отряд † Aetosauria
Отряд † Phytosauria
Группа † Avemetatarsalia
Группа † Ornithodira
Группа † Dinosauriformes
Семейство † Silesauridae
Отряд † Птерозавры или летающие ящеры (Pterosauria):
Надотряд † Динозавры (Dinosauria) (кроме птиц)
Отряд † Ящеротазовые динозавры (Saurichia) — вымерли, возможно, дали начало птицам
Отряд † Птицетазовые динозавры (Ornithischia)