По особенностям рельефа Мадагаскар подразделяется на три параллельные полосы, простирающиеся с севера на юг. Вдоль всего восточного побережья четко выражена узкая полоса низменностей. К югу от Туамасины прослеживается почти непрерывная цепь лагун, соединенных между собой каналом Пангалан. На западе прибрежная низменность более широкая, а ее переход к горам менее четко выражен. Между этими низменностями расположено расчлененное нагорье. Самая высокая точка находится на севере – гора Марумукутру (2876 м), но наиболее крупной поднятой частью нагорья является массив Анкаратра, расположенный к юго-западу от Антананариву, где гора Циатадзавуна достигает 2643 м. Средние высоты нагорья колеблются от 1200 до 1500 м. Северо-восточнее Антананариву находится оз. Алаутра, самое крупное в пределах нагорья. Восточный край нагорья в целом подходит ближе к берегу и поднят гораздо выше западного; он круто обрывается к прибрежной низменности. Хребты в водораздельной части нагорья простираются параллельно восточному берегу, тогда как на западе они нередко ориентированы с северо-запада на юго-восток.
На участке от Тауланару до Туамасины восточный берег сильно выровнен. На литорали расчлененные коралловые рифы обеспечивают некоторую защиту судоходства. Далее к северу между Туамасиной и бухтой Антунгила находится единственный остров у восточного побережья – Нуси-Бураха (Сент-Мари). На крайнем севере расположена глубокая и надежно защищенная гавань Анцеранана, главная военно-морская база страны. Западный берег расчлененный, и его северная треть глубоко изрезана бухтами. Мадагаскар богат подводными порожистыми реками. Все длинные реки текут к западу, и их устья обычно блокируются песчаными отмелями. Крупнейшие реки, имеющие сток в западном направлении: Суфиа, Махадзамба, Бецибука, Махавави, Манамбулу, Цирибихина, Мангуки и Унилахи. Махадзанга – главный порт на западном берегу, а Туамасина – на восточном, это также главный порт страны. Канал Пангалан, соединяющий между собой лагуны восточного побережья, обеспечивает прохождение небольших каботажных судов на протяжении 480 км.
Климат Мадагаскара в основном тропический. На низменностях средние месячные температуры колеблются от 20–26° до 30° С, на Центральном нагорье от 13° до 20° С. Поскольку преобладают юго-восточные ветры, на восточном побережье и восточных склонах гор выпадает больше осадков, чем в западных водосборных бассейнах на западе острова. Только на крайнем юго-западе климат близок к семиаридному субэкваториальному. Там выпадает всего 250 мм осадков в год. В ряде местностей восточного побережья средняя годовая сумма осадков превышает 2500 мм. В центральной части нагорья выпадает 1000–1500 мм в год (в Антанариву – 1400 мм), а в западной – 500–600 мм. В горах летом (с ноября по апрель) обычно жарко и влажно, а зимой соответственно прохладно и сухо. Иногда бывают случайные заморозки и град, но никогда не выпадает снег. Восточное побережье попадает в зону циклонов, однако западные низменности защищены горами от их воздействия.
