Чистые линии - это группа организмов, у которых на протяжении нескольких поколений наследуется один и тот же признак (признаки).
Есть еще такое определение, но оно относится только к растениям:
Чистые линии -это когда при самоопылении наблюдается однообразие потомства (несут один признак).
Именно чистые линии использовал Грегор Мендаль, что и позволило ему выявить закономерности.
В животноводстве и растениеводстве -это имеет другое название чистосортность, чистопородность, у микроорганизмов - штамм.