Однородные члены имеют один и тот же корень и обязательно должны значить примерно одно и то же. Например, слова "машина" и "машинист" имеют корень "машин", а вот слова "вода" и "водитель" хоть и имеют одинаковый корень "вод", но означают разное, и они уже не однородные.
Второстепенные члены предложения не входят в основу предложения. Чаще всего основа состоит из существительного в именительном падеже и глагола, напрямую относящемуся к нему ( например, "часы идут" - основа, а "несет лепестки" уже глагол с второстепенным членом предложения.)