Общего в них то, что они не являются членами предложения, и оба вспомогательные части речи. Отличия заключаются в том, что союзы соединяют простые предложения в составе сложного или однородные члены, а предлоги соединяют слова в словосочетаниях. Собственно, вот и всё.