Гифы микобионта имеют гораздо более толстые оболочки, чем гифы свободноживущих грибов. Они способны сильно набухать и ослизняться, удерживая избыток влаги. Водоросли в составе лишайника способны длительно переносить недостаток воды, света и фотосинтезировать в экстремальных условиях. У лишайника в целом иные продукты обмена (вторичные лишайниковые вещества, лишайниковые кислоты) чем у их свободноживущих компонентов.