Большую часть фауны Сибири составляют беспозвоночные животные – пауки, насекомые и прочие членистоногие. Среди позвоночных в большинстве встречаются птицы. Немного меньше в этом крае амфибий, рептилий, рыб и млекопитающих.
В Сибири обитает 10 тысяч видов насекомых, из них – 54 занесено в Красную книгу. Одно из самых знаменитых – крупная и яркая бабочка аполлон, встречающаяся на Буготакских сопках.
Из 78 видов млекопитающих в Красную книгу занесено 19. Среди них – речной бобр, обитающий на северных реках Тара, Тартас, в пойме Ини – реки Черепановского района.
Встречается здесь также более 300 видов разнообразных птиц. Из них в Красной книге - 74 вида. К примеру, возглавляет список самых редких сов бородатая неясыть – одна из крупнейших в мире, уступающая в размерах разве что филину. На побережье можно увидеть поселения грациозных куликов шилоклювок. Но самый редкий вид куликов – это тонкоклювый кроншнеп. Одна из самых красивых птиц Сибири – краснозобая казарка, обитающая в тундре. Одним словом, редких птиц здесь очень много.
Реки и озера Сибири наполнены рыбой – здесь можно увидеть более 30 их разновидностей. В Красную книгу занесены: сибирский хариус, таймень, нельма, муксун, сибирский осётр, стерлядь.