В результате реформы системы народного просвещения, проведенной при Александре I университетам предоставлялась широкая автономия. Автономия предоставлялась на основании первого в России Университетского устава 1804 года. Устав устанавливал выборность ректора и профессуры, университетский суд, право университетов назначать учителей в гимназии и училища своего учебного округа, невмешательство высшей администрации в дела университетов.