Ответ: Винительный падеж.
Считать (что? ) яблоки (В.п.)
Если у тебя возникают сомнения поставь на место неодушевленного существительного , одушевленное и тут же изменится вопрос. Например:
Считать (кого?) цыплят ....
Это вопрос Винительного падежа.
Ты же не можешь сказать : считать (кто?) ....