В течении реки (управление - главное слово требует от зависимого определённого падежа. когда главное по падежу меняется, зависимое не меняется: течение реки-течения реки-течению реки и т.д.)
с серыми глазами (согласование - главное и зависимое в одинаковом роде, числе и падеже. когда главное меняется, зависимое тоже меняется: серые глаза-серых глаз-серым глазам)
немало систем (управление - всегда там, где зависимое слово - неизменяемая часть речи, т.е. начальная форма глагола, дееспричастие или наречие)