Аргинин, содержащий гуанидиновую группировку, является сильно основной аминокислотой, вблизи нейтральных значений рН его боковые цепи полностью протонированы и молекула заряжена положительно.
Поэтому при электрофорезе аргинин движется к отрицательному электроду, к катоду.