Прилагательное ненастный в значении "хмурый, дожливый, пасмурный" образовано от исконно русского существительного ненастье, которое в свою очередь возникло приставочным способом от утраченного слова настье - хорошая солнечная сухая погода.
Так как слово настье уже не употребляется без не (как отрицание), пишется е