Размеры молекул зависят от количества атомов в них.
Самая маленькая молекула - водорода (H2) имеет размеры порядка 10^(-5) см. Размер атома водорода порядка 10^(-8) см.
Размеры некоторых белковых соединений могут доходить до сантиметра в длину (возможно, больше) . Ну. если прикинуть, что в ДНК человека сотни тысяч белковых соединений, то, развернув в линию получим отрезок в несколько сантиметров.
Не понял вопрос "как протекает диффузия в жидкостях". Что значит "как"? Диффузия - процесс смешивания двух жидких/газообразных веществ под влиянием броуновского движения.