Томат - это промышленное название помидора. Помидор - разговорное название томата. В производственных документах или статьях вы вряд ли встретите слово "помидор", за исключением случаев стилевых потребностей. С повышением уровня грамотности населения, по моему предположению, люди стали шире употреблять слово "томат" вместо помидора, и еще, часто на фабричных банках часто пишут "томаты", поэтому слово более широко вошло и в разговорный язык.