Компьютер - это электронное устройство, а в таких устройствах проще всего реализовать именно двоичную систему кодирования хранения и передачи информации. Поясню почему: для хранения информации, например в оперативной памяти, есть заряд - 1; нет заряда - 0, (а на жестком диске: есть намагниченность - 1, нет намагниченности - 0). При передачи информации по проводу (по шине) есть ток - 1, нет тока - 0. То есть это очень простой, понятный и эффективный способ, и не надо ничего сложного выдумывать.