Мониторинг может проводиться не только в природе, но и по материалам, накопленным в научных учреждениях. Например, во многих естественных музеях хранятся коллекции видов различных групп организмов, собранные на протяжении столетий. Исследование таких коллекций позволяет выявить изменения ареалов или строения организмов за определенный промежуток времени, исследовать внутривидовую географическую или экологическую изменчивость подобное.