(Кто?) Дюймовочка - подлежащее (подчеркивается сплошной одной линией _ ) выражена существительным, в И.п.
Дюймовочка (кто?) - девочка. Это сказуемое, выражено существительным в И.п.
Если подлежащее и сказуемое выражено существительными в Именительном падеже, между ними ставится тире.