Если в кратце, основные различия между папоротниками и мхами заключаются в том, что
1-у мхов гаплоидный набор, у папоротников-диплоидный
2-у папоротников есть корневище с большим количесвтом придаточных корней, у мхов- корней нет
3-стадией гаметофита у мха является взрослое растение, а у папоротников - заросток
4-ткани мхов почти не дифференцированы, в отличие от папоротников
В общем, это самые главные отличия, но их ещё много-полистайте учебник биологии!