в слове водопровод два корня, первый корень – вод (однокоренные слова – вода, водный, водяной), а вот второй корень тоже вод, но это совсем другой корень, омоним первого, однокоренные слова ко второму корню – водить, водитель, проводить, наводка, привод и пр.
Слово водопровод образовалось путём сложения основ слов вода и проводить при помощи соединительной гласной (интерфикса) О. Во втором слове есть приставка ПРО-:, эта приставка сохранилась в слове водовод. про
Приставка во многих сложных словах находится перед вторым корнем:
вод/о/про/вод/ – корень/интерфикс/приставка/корень/нулевое окончание.
Такое же строение у слов:
нефт/е/про/вод/;
газ/о/про/вод/;
пут/е/про/вод/;
мусор/о/про/вод и пр.
Приставка перед вторым корнем есть и в таких словах, как:
шахт/о/про/хо́д/чик/ – корень/интерфикс/приставка/корень/суффикс/нулевое окончание;
кон/н/о/за/вод/чик/ – корень/суффикс/интерфикс/приставка/корень/суффикс/нулевое окончание;
мир/о/воз/зр/е́ни/е [й/э] – корень/интерфикс/приставка/корень/суффикс/окончание.